Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms