Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms