Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms