Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms