Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRG3Q99928 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms