Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.42
RSF1Q96T23 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RSF1Q96T23 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms