Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ODF3Q96PU9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ODF3Q96PU9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ODF3Q96PU9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ODF3Q96PU9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ODF3Q96PU9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ODF3Q96PU9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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