Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARAP1Q96P48 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARAP1Q96P48 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms