Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCLT1Q96NL6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms