Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms