Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms