Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms