Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms