Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms