Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms