Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms