Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms