Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms