Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAF2Q96CS3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms