Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA10Q969M2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA10Q969M2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms