Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3CQ92520 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3CQ92520 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms