Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms