Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO3Q8TAP4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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