Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYRIPQ8NFW9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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