Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms