Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms