Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARRDC4Q8NCT1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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