Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRC17Q8N6Y2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC17Q8N6Y2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms