Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSGALNACT2Q8N6G5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms