Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF1Q8N6C5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF1Q8N6C5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF1Q8N6C5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF1Q8N6C5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF1Q8N6C5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF1Q8N6C5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms