Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C17orf53Q8N3J3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms