Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms