Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms