Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YTHDF3Q7Z739 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms