Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms