Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms