Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SV2AQ7L0J3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SV2AQ7L0J3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SV2AQ7L0J3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SV2AQ7L0J3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SV2AQ7L0J3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SV2AQ7L0J3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SV2AQ7L0J3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SV2AQ7L0J3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SV2AQ7L0J3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SV2AQ7L0J3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SV2AQ7L0J3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SV2AQ7L0J3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SV2AQ7L0J3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms