Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms