Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms