Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCBE1Q6UXH8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms