Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSTM1Q6UX27 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms