Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms