Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms