Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC137Q6PK04 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms