Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF549Q6P9A3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms