Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EDC4Q6P2E9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms