Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT80Q6KB66 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms