Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms