Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD40Q6AI12 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms