Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPECC1LQ69YQ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms